衢州市食品药品检验研究院（衢州市医疗器械质量监督检验所）隶属于衢州市市场监督管理局，为正科级公益一类事业单位，同时挂“国家粮食质量衢州监测站、浙江省保健食品化妆品检验检测中心衢州工作站、衢州市粮油质量检验监测中心、衢州市医疗器械质量监督检验所”等牌子。该院共有实验用房8000多平方米，拥有一支高素质团队，现在职人员54人，本科以上学历人员占职工总数87%，具有中级及以上专技职称人员占职工总数的64％；配有一批高精尖仪器设备，如高分辨液质联用仪、液质质联用仪、液质联用仪、气质质联用仪、气质联用仪、同位素质谱仪、电感耦合等离子体质谱仪、气相色谱仪、高效液相色谱仪、原子吸收分光光度计、全自动细菌检定仪等大型精密仪器设备，设备原值超4000万元。