湖州市食品药品检验研究院是湖州市市场监督管理局隶属的专业食品药品检验机构，是国家食品药品监督保证体系的组成部分，是承担国家对食品药品质量实施技术监督任务的法定机构，是全额拨款的事业单位，是独立运作的市场法人主体，并执行市场监督管理部门交办的食品药品技术监督任务。单位始建于1978年，原名为“湖州市食品药品检验所”。2014年机构整合后，更名为“湖州市食品药品检验研究院”，同时增挂“湖州市药品与医疗器械不良反应监测中心”、“湖州市食品药品认证审评中心”、“湖州市医疗器械监督检验中心”牌子。2015年增挂“湖州市粮油质量检验监测中心”牌子。主要职责是承担食品、药品、化妆品、保健食品、医疗器械等产品的检验检测及相关技术工作，本市行政区域内药品不良反应和医疗器械不良事件监测工作，食品的技术审查、技术评审和认证管理工作，食品药品安全突发事件的应急检验和处置等工作。    本院于1994年12月首次通过浙江省质量技术监督部门计量认证考核，现有检测能力涉及食品、药品、保健食品、化妆品、医疗器械、药包材、洁净区环境、食品添加剂等8大领域。至2023年11月，拥有职工57人，本科及以上学历54人，占总人数90%以上，硕士研究生5人，博士研究生1人；中级职称28人，高级职称13人，中级以上职称占总人数72%。内设办公室、业务室、质量管理室、认证审评室四个职能科室和食品室、化学室、中药室、生测室四个检验科室。全院总建筑面积约12000平方米，其中，实验楼8900平方米，实验动物中心887平方米(系湖州市唯一的屏障级动物饲养、实验室)，并建有湖州市食品药品宣教中心与湖州地产药食同源植物园。目前拥有液相色谱-串联质谱仪、气相色谱-质谱联用仪、电感耦合等离子体质谱、液相色谱仪、气相色谱仪、原子吸收光谱仪、PCR仪、全自动致病菌检测系统等大型仪器40余台套。