余姚市疾病预防控制中心于2002年04月28日正式成立，它是在原余姚市卫生防疫站（创建于1956年5月）的基础上组建的直属于余姚市卫生和计划生育局的具有独立法人、独立承担第三方公正检验、独立对外行文和开展业务活动，有独立帐目和独立核算的卫生事业单位。 2018年7月中心全部搬迁至万年桥路28号，并于8月22日通过了浙江省市场监督管理局地址变更申请。目前中心由3幢大楼组成，总建筑面积5547.20平方米，其中3号楼主要是实验用房，建筑面积1800平方米。建有100级洁净室、艾滋病初筛实验室、二级生物安全实验室、分子生物实验室等各类专业实验室。同时，实验室设有醒目的包括生物安全等禁示标志、门禁系统、隔离缓冲装置、工作人员更衣室，各检测室分隔合理，有程序确保良好的内务管理。 实验室配有原子吸收仪、气相色谱仪、液相色谱仪、离子色谱仪、全自动细菌鉴定仪、实时荧光定量PCR仪等一大批高精检测设备。对仪器设备和标准物质、标准菌株从请购、验收、保管、使用、维护、报废等各个环节都严格按规范操作，并做好检定/校准、期间核查、维护等相关工作。